Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms