Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VwceQ3U515 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VwceQ3U515 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms