Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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