Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms