Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms