Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms