Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms