Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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