Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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