Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem71Q149F5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem71Q149F5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms