Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms