Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms