Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms