Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms