Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms