Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp2Q06649 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp2Q06649 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp2Q06649 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp2Q06649 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp2Q06649 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp2Q06649 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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