Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nf1Q04690 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms