Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms