Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme2Q01768 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms