Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms