Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms