Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms