Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smyd1P97443 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smyd1P97443 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms