Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx1P83917 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms