Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb13P70321 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb13P70321 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms