Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms