Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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NfixP70257 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfixP70257 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NfixP70257 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NfixP70257 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NfixP70257 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NfixP70257 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfixP70257 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NfixP70257 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NfixP70257 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms