Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcbP68404 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms