Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms