Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms