Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp46P62069 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp46P62069 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp46P62069 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp46P62069 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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