Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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