Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms