Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sem1P60897 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sem1P60897 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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