Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CgnP59242 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CgnP59242 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CgnP59242 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms