Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl3P58873 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms