Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms