Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PctpP53808 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PctpP53808 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PctpP53808 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms