Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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