Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FmodP50608 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FmodP50608 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FmodP50608 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FmodP50608 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms