Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms