Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpreP49446 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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