Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms