Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca1P48754 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms