Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms