Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms