Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms