Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VhlP40338 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VhlP40338 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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