Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf1P39428 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms