Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig1P37913 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms